Primary photodynamics of a biomimetic model of photoactive yellow protein (PYP)

文献情報

出版日 2010-09-21
DOI 10.1039/C0CP00618A
インパクトファクター 3.676
著者

Pascale Changenet-Barret, Christina Loukou, Christian Ley, Fabien Lacombat, Pascal Plaza, Jean-Maurice Mallet, Monique M. Martin


原文を見る

要旨

The present work aims at characterizing the photophysical behavior of a first biomimetic cyclodextrin model (CD-PYP1) of the photoactive site of photoactive yellow protein (PYP). The hydrophobic cyclodextrin cavity in which the chromophore self-includes, mimics its local environment within the protein. The photoinduced behavior of deprotonated CD-PYP1 (dp-CD-PYP1) has been probed by femtosecond transient-absorption spectroscopy and compared to those of the free deprotonated chromophore (pCT−) and of wild-type PYP. The excited-state deactivation of dp-CD-PYP1 is found to be non-exponential, with slower time components and higher quantum yield of fluorescence than pCT−. Like in PYP, the non-exponential decay is attributed to ground-state structural heterogeneities of the self-inclusion complexes. A long-lived photoproduct is observed in the transient spectra of dp-CD-PYP1 and identified as the cis isomer. The isomerization quantum yield of dp-CD-PYP1 is estimated to be about 4%, in contrast with the free chromophore in solution which does not photoisomerize at all. This demonstrates the active role of the cyclodextrin environment to promote the photoisomerization of the chromophore, as is thought to be the case for wild-type PYP. The effects of chromophore inclusion in the cyclodextrin on the photoinduced processes are rationalized within the framework of recent theoretical calculations involving two competitive deactivation channels: (i) trans to cis isomerization and (ii) rotation of the phenolate group, leading to trans ground-state recovery. Inclusion is proposed to favor isomerization by hindering the rotation of the phenolate group. Optimizing the structure of this first model in order to better reproduce the primary photoresponse of PYP thus appears very promising.

関連文献

Inside back cover

Cover

DOI: 10.1039/C6CP90281B

Microwave-gated dynamic nuclear polarization

Aurélien Bornet, Arthur Pinon, Lyndon Emsley

2016-09-30 Paper

DOI: 10.1039/C6CP05587G

Is kinetic polymer arrest very specific to multiwalled carbon nanotubes?

Priti Xavier, Keerthi M. Nair, Lasitha K., Suryasarathi Bose

2016-09-23 Paper

DOI: 10.1039/C6CP04303H

Interplay between surface and surface resonance states on height selective stability of fcc Dy(111) film at nanoscale

Xiaojie Liu, Cai-Zhuang Wang, Myron Hupalo, Kai-Ming Ho, Patricia A. Thiel, Michael C. Tringides

2016-11-02 Paper

DOI: 10.1039/C6CP05639C

Unravelling the fundamentals of thermal and chemical expansion of BaCeO3 from first principles phonon calculations

Andreas Løken, Reidar Haugsrud, Tor S. Bjørheim

2016-10-19 Paper

DOI: 10.1039/C6CP05710A

Warburg's impedance revisited

2016-10-04 Paper

DOI: 10.1039/C6CP05049B

Aun (n = 1–16) clusters on the ZrO2(111) surface: a DFT+U investigation

Ming-Xing Liang, Liang Zhao

2016-10-12 Paper

DOI: 10.1039/C6CP05977E

Defect enabled formation of multilayered funnel from isolated graphene nanoring

Lijie Zhong, Shuqiong Xu, Hongjin Fu, Zhaoxin Lu, Danhui Zhang

2016-10-24 Paper

DOI: 10.1039/C6CP06739E

こちらもおすすめ

化合物よくある質問

(S)-四氢呋喃-3-羧酸の物理化学的性質は何ですか?

CAS番号168395-26-4の(S)-四氢呋喃-3-羧酸は、白色の結晶が特徴的な性質を持ちます。分子量は128.08であり、水に溶けやすく、アルコールなど...

168395-26-4(3S)-Tetrahydro-3-fu...
化合物よくある質問

塩基性硫黄化合物1,3-ジメチル-1-[5-(三氟甲基)-1,3,4-硫杂环己二酮-2-基]尿素を含む廃棄物はどのように処理すべきですか?

塩基性硫黄化合物1,3-ジメチル-1-[5-(三氟甲基)-1,3,4-硫杂环己二酮-2-基]尿素を含む廃棄物は、専門的な廃棄処理施設で焼却処理を行うべきです。ま...

25366-23-81,3-Dimethyl-1-[5-(t...
化合物よくある質問

インドリジン-2-カルボン酸は安全ですか?

インドリジン-2-カルボン酸は一般的に安全ですが、過度に濃い状態では刺激性があります。取り扱いには適切な防護具を使用し、直接触れや吸入を避ける必要があります。

3189-48-8Indolizine-2-carboxy...
化合物よくある質問

5-甲基-2-(3-ピリジニル)-1,3-テイゾール-4-オールの市場動向や研究トレンドはどうですか?

5-甲基-2-(3-ピリジニル)-1,3-テイゾール-4-オールは、医薬品や農薬、および合成化学の分野において研究が進められています。市場動向としては、化学物質...

131786-48-65-Methyl-2-(3-pyridi...
化合物よくある質問

4,4',4''-(嘧啶-2,4,6-三基)三苯甲醛はどのように保存すればよいですか?

4,4',4''-(嘧啶-2,4,6-三基)三苯甲醛は、密閉容器に保管し、避けておくことが重要です。室温で保管し、直射日光を避けてください。

2230887-23-54,4',4''-(2,4,6-Pyri...
化合物よくある質問

(3aR)-1,3,3-トリフェニルテトラヒドロ-3H-ピロロ[1,2-c][1,3,2]-オキザボロロールについて、適用される法規ガイドラインは何ですか?

(3aR)-1,3,3-トリフェニルテトラヒドロ-3H-ピロロ[1,2-c][1,3,2]-オキザボロロールは、GHS(国際危険物識別ルール)の分類が適用されま...

145238-45-5(3aR)-1,3,3-Tripheny...
化合物よくある質問

N,N-ジブチルプロパニジアミンの主な用途は何ですか?

N,N-ジブチルプロパニジアミンは主にアクリル酸エステルの固化剤、界面活性剤、及び農薬の製造材料として使用されます。

102-83-0N,N-Dibutyl-1,3-prop...
化合物よくある質問

6-(4-氯苯氧基)吡啶-3-胺の代替品はありますか?

6-(4-氯苯氧基)吡啶-3-胺の代替品としては、他の芳香族アミン化合物や類似の除草剤が考えられます。ただし、他の化合物と同様に、代替品の選択には安全性と効果性...

75926-64-66-(4-Chlorophenoxy)-...
化合物よくある質問

4-甲基伞形酮硬脂酸酯は安全ですか?

4-甲基伞形酮硬脂酸酯は安全性に関しては一定の注意が必要で、直接的な皮膚刺激や吸入毒性は報告されていませんが、吸入は避けるべきです。

79408-85-84-Methyl-2-oxo-2H-ch...
化合物よくある質問

3-フェニル-3,4-ジヒドロ-2H-1,4-ベンゾキサジンを取り扱う際の実験室安全事項は何ですか?

3-フェニル-3,4-ジヒドロ-2H-1,4-ベンゾキサジンを取り扱う際は、防塵マスク、ゴーグル、ゴム手袋を使用し、ドラフトチャンバー内で作業することを推奨しま...

70310-30-43-Phenyl-3,4-dihydro...

掲載誌

Physical Chemistry Chemical Physics

Physical Chemistry Chemical Physics
CiteScore: 5.5
自己引用率: 10.3%
年間論文数: 3036

Physical Chemistry Chemical Physics (PCCP) is an international journal co-owned by 19 physical chemistry and physics societies from around the world. This journal publishes original, cutting-edge research in physical chemistry, chemical physics and biophysical chemistry. To be suitable for publication in PCCP, articles must include significant innovation and/or insight into physical chemistry; this is the most important criterion that reviewers and Editors will judge against when evaluating submissions. The journal has a broad scope and welcomes contributions spanning experiment, theory, computation and data science. Topical coverage includes spectroscopy, dynamics, kinetics, statistical mechanics, thermodynamics, electrochemistry, catalysis, surface science, quantum mechanics, quantum computing and machine learning. Interdisciplinary research areas such as polymers and soft matter, materials, nanoscience, energy, surfaces/interfaces, and biophysical chemistry are welcomed if they demonstrate significant innovation and/or insight into physical chemistry. Joined experimental/theoretical studies are particularly appreciated when complementary and based on up-to-date approaches.

おすすめ化合物

おすすめサプライヤー

免責事項
このページに表示される学術雑誌情報は、参考および研究目的のみを目的としています。当社は雑誌出版社とは提携しておらず、投稿の取り扱いも行っておりません。出版に関するお問い合わせは、各雑誌出版社に直接ご連絡ください。
表示されている情報に誤りがある場合は、support@chemtradehub.com までご連絡ください。迅速に確認し、対応いたします。