Theoretical investigation of the coupling between hydrogen atoms transfer and stacking interaction in guanine–cytosine dimers

文献情報

出版日 2013-09-20
DOI 10.1039/C3CP52855C
インパクトファクター 3.676
著者


原文を見る

要旨

The effect of the stacking interaction on some properties of the guanine–cytosine (G–C) base pair has been studied. In particular, the strength of the hydrogen bonds, the mechanism of hydrogen transfer and the charge redistribution intra- and inter-base pair have been analyzed in the three canonical dimers. The inclusion of both the stacking interaction and of the hydrogen bond interaction between the bases allows us to study both the local and the long-range phenomena of DNA. The comparison of these results with those of the G–C monomeric system supports the idea that the variations of these properties depend from the exact dimer considered and are different for one or another hydrogen bond. Also the different mechanisms of two hydrogen transfer (step to step and concerted) can be modified by the stacking interaction between the base pairs. The comparison with previous data shows that some generalizations found in literature must be analyzed in detail.

関連文献

Trap-limited charge recombination in intrinsic perovskite film and meso-superstructured perovskite solar cells and the passivation effect of the hole-transport material on trap states

Yi Wang, Hao-Yi Wang, Man Yu, Li-Min Fu, Yujun Qin, Jian-Ping Zhang, Xi-Cheng Ai

2015-10-13 Communication

DOI: 10.1039/C5CP04360C

Accurate and efficient linear scaling DFT calculations with universal applicability

Stephan Mohr, Luigi Genovese, Damien Caliste, Paul Boulanger, Stefan Goedecker, Thierry Deutsch

2015-04-27 Paper

DOI: 10.1039/C5CP00437C

Contents list

Front/Back Matter

DOI: 10.1039/C6CP90005D

Gas-phase synthesis of Mg–Ti nanoparticles for solid-state hydrogen storage

M. Calizzi, F. Venturi, M. Ponthieu, F. Cuevas, V. Morandi, T. Perkisas, S. Bals, L. Pasquini

2015-11-05 Paper

DOI: 10.1039/C5CP03092G

Single water solvation dynamics in the 4-aminobenzonitrile–water cluster cation revealed by picosecond time-resolved infrared spectroscopy

Mitsuhiko Miyazaki, Takashi Nakamura, Matthias Wohlgemuth, Roland Mitrić, Otto Dopfer, Masaaki Fujii

2015-10-08 Paper

DOI: 10.1039/C5CP05400A

Mechanistic insights into nitrogen fixation by nitrogenase enzymes

Y. Wang, K. Chan

2015-09-09 Paper

DOI: 10.1039/C5CP04034E

Gas-phase structure of 2,2,2-trichloroethyl chloroformate studied by electron diffraction and quantum-chemical calculations

Diego M. Gil, María E. Tuttolomondo, Sebastian Blomeyer, Christian G. Reuter, Norbert W. Mitzel, Aída Ben Altabef

2015-11-23 Paper

DOI: 10.1039/C5CP05295E

こちらもおすすめ

化合物よくある質問

カルボニル基が付いた5-氰基-1-{[(2-メチル-2-プロpanyl)オキシ]カーボンイル}1H-吲哚-2-イリド-2-ボリン酸はどのように保存すればよいですか?

カルボニル基が付いた5-氰基-1-{[(2-メチル-2-プロpanyl)オキシ]カーボンイル}1H-吲哚-2-イリド-2-ボリン酸は、直射日光を避けて室温(15...

475102-15-9(5-Cyano-1-{[(2-meth...
化合物よくある質問

tert-ブチル2-クロロメチルピリジン-3-基炭酸エステルの市場動向や研究トレンドはどうですか?

この化合物は合成化学分野において、特にピリジン化合物の合成や改良に用いられます。最近の研究では、ピリジン化合物の新規合成法や特性の改良が注目されています。市場動...

1203498-98-9tert-Butyl 2-chloro-...
化合物よくある質問

聚二季戊四醇六丙烯酸酯はどの業界で使用されていますか?

聚二季戊四醇六丙烯酸酯は、医薬品、ポリマー、センサー、半導体などの業界で広く使用されています。特にポリマー業界では硬化剤として、医薬分野では医療機器の製造に使用...

29570-58-93-(Acryloyloxy)-2-({...
化合物よくある質問

1-氯-5-硝基异喹啉の市場動向や研究トレンドはどうですか?

1-氯-5-硝基异喹啉は、薬理学や合成化学の研究分野で注目されています。市場動向としては、その生物学的な活性や合成可能性を評価する研究が増えています。また、代替...

58142-97-51-Chloro-5-nitroisoq...
化合物よくある質問

2-チロール-5-メチルスルフェニル-3-trifルオルメチルベンゼンはどのように合成されますか?

2-チロール-5-メチルスルフェニル-3-trifルオルメチルベンゼンは、トリフルオロメチル化反応と硫化反応を経て合成されます。通常、トリフルオロメチル化剤と硫...

957066-04-51-Chloro-4-(methylsu...
化合物よくある質問

p-トールイルマグネシウムブロミドの物理化学的性質は何ですか?

p-トールイルマグネシウムブロミドのCAS番号は4294-57-9です。この化合物は白色の結晶性粉末で、分子量は204.32です。溶剤中で良好に溶解しますが、水...

4294-57-9p-Tolylmagnesium bro...
化合物よくある質問

1-(5-甲基-2-硫化素基)プロパン-1-酮の市場動向や研究トレンドはどうですか?

1-(5-甲基-2-硫化素基)プロパン-1-酮の市場動向は、化学産業全体の需要に影響を受けますが、最近では pharmaceutical 分野での応用が注目され...

59303-13-81-(5-Methyl-2-thieny...
化合物よくある質問

十一碳烯酰甘氨酸を取り扱う際の実験室安全事項は何ですか?

十一碳烯酰甘氨酸は吸入や皮膚から吸収されることがあり、取り扱う際には防塵マスクと手袋を使用してください。ドラフトチャンバーを用いて漏洩を処理し、適切なSDS(S...

54301-26-7N-10-Undecenoylglyci...
化合物よくある質問

1H,1H-全氟-3,6-二氧杂葵-1-醇を取り扱う際の実験室安全事項は何ですか?

この化合物は吸入や皮膚吸収による毒性があるため、防塵マスク、ゴーグル、防護手袋を使用する必要があります。ドラフトチャンバーでの操作が必要です。漏洩時には即座に換...

152914-73-32,2-Difluoro-2-[1,1,...
化合物よくある質問

3-(4-(フルオロメチルオキシ)フェニル)-1,2,4-オキサジアゾール-5-カルボハイドライドは安全ですか?

安全性は化合物の使用方法によります。直接的な毒性は報告されていませんが、吸入や皮膚接触には注意が必要です。適切な防護服を着用し、換気を図ることを推奨します。

883028-82-83-(4-(Trifluorometho...

掲載誌

Physical Chemistry Chemical Physics

Physical Chemistry Chemical Physics
CiteScore: 5.5
自己引用率: 10.3%
年間論文数: 3036

Physical Chemistry Chemical Physics (PCCP) is an international journal co-owned by 19 physical chemistry and physics societies from around the world. This journal publishes original, cutting-edge research in physical chemistry, chemical physics and biophysical chemistry. To be suitable for publication in PCCP, articles must include significant innovation and/or insight into physical chemistry; this is the most important criterion that reviewers and Editors will judge against when evaluating submissions. The journal has a broad scope and welcomes contributions spanning experiment, theory, computation and data science. Topical coverage includes spectroscopy, dynamics, kinetics, statistical mechanics, thermodynamics, electrochemistry, catalysis, surface science, quantum mechanics, quantum computing and machine learning. Interdisciplinary research areas such as polymers and soft matter, materials, nanoscience, energy, surfaces/interfaces, and biophysical chemistry are welcomed if they demonstrate significant innovation and/or insight into physical chemistry. Joined experimental/theoretical studies are particularly appreciated when complementary and based on up-to-date approaches.

おすすめサプライヤー

免責事項
このページに表示される学術雑誌情報は、参考および研究目的のみを目的としています。当社は雑誌出版社とは提携しておらず、投稿の取り扱いも行っておりません。出版に関するお問い合わせは、各雑誌出版社に直接ご連絡ください。
表示されている情報に誤りがある場合は、support@chemtradehub.com までご連絡ください。迅速に確認し、対応いたします。