Atomic fragment approximation from a tensor network

文献情報

出版日 2023-10-13
DOI 10.1039/D3DD00130J
インパクトファクター 0
著者

Haoxiang Lin, Xi Zhu


原文を見る

要旨

We propose atomic-fragment approximation (AFA), which uses the tensor network (TN) as a platform to estimate the molecular properties through “adding up” fragment properties. The AFA framework employs graph neural networks to predict the matrix product states (MPSs) for atoms and matrix product operators (MPOs) for bonds, which are then contracted to obtain the full TN for the full molecule. Subsequent neural network layers then predict molecular properties based on the TN contraction outcome. AFA addresses the limitation of density functional approximation (DFA) by reusing previously calculated results and maintaining constant complexity in fragment contraction regardless of the fragment size. We further show that AFA can overcome error accumulation by optimizing the intermediate fragments. AFA demonstrates the ability to predict the reaction intermediates by calculating and comparing the bond-breaking energies. The experiment also showcases excellent accuracy in reaction intermediate prediction and reaction energy prediction.

関連文献

Solvent-mediated molar conductivity of protic ionic liquids

Sachin Thawarkar, Nageshwar D. Khupse, Anil Kumar

2014-11-05 Paper

DOI: 10.1039/C4CP04591B

Unusual electroluminescence from n-ZnO@i-MgO core–shell nanowire color-tunable light-emitting diode at reverse bias

Xiaoming Mo, Guojia Fang, Hao Long, Songzhan Li, Haoning Wang, Zhao Chen, Huihui Huang, Wei Zeng, Yupeng Zhang, Chunxu Pan

2014-02-26 Paper

DOI: 10.1039/C3CP55505D

On the mechanism of nanoparticle formation in a flame doped by iron pentacarbonyl

Marina Poliak, Alexey Fomin, Vladimir Tsionsky, Sergey Cheskis, Irenaeus Wlokas, Igor Rahinov

2014-11-11 Paper

DOI: 10.1039/C4CP04454A

The influence of the electrolyte on chemical and morphological modifications of an iron sulfide thin film negative electrode

Feng Liao, Jolanta Światowska, Vincent Maurice, Antoine Seyeux, Lorena H. Klein, Sandrine Zanna, Philippe Marcus

2014-11-10 Paper

DOI: 10.1039/C4CP04041D

Enhancement of hydrogen production using photoactive nanoparticles on a photochemically inert photonic macroporous support

Robert Mitchell, Rik Brydson, Richard E. Douthwaite

2014-11-10 Paper

DOI: 10.1039/C4CP04333B

Identification of an emitting molecular species by time-resolved fluorescence applied to the excited state dynamics of pigment yellow 101

Seung Noh Lee, Jaeheung Park, Manho Lim, Taiha Joo

2014-03-26 Paper

DOI: 10.1039/C3CP54546F

Highly regioselective hydride transfer, oxidative dehydrogenation, and hydrogen-atom abstraction in the thermal gas-phase chemistry of [Zn(OH)]+/C3H8‡

Xiao-Nan Wu, Hai-Tao Zhao, Jilai Li, Maria Schlangen, Helmut Schwarz

2014-09-12 Paper

DOI: 10.1039/C4CP02139H

A comparative structural study in monolayers of GPI fragments and their binary mixtures

C. Stefaniu, I. Vilotijevic, G. Brezesinski

2014-03-18 Paper

DOI: 10.1039/C4CP00567H

Graphene-mediated surface enhanced Raman scattering in silica mesoporous nanocomposite films

Davide Carboni, Barbara Lasio, Valeria Alzari, Alberto Mariani, Danilo Loche, Maria F. Casula, Luca Malfatti, Plinio Innocenzi

2014-09-18 Paper

DOI: 10.1039/C4CP03582H

こちらもおすすめ

化合物よくある質問

S-(甲硅烷基丙基)異硫酰氯を取り扱う際の実験室安全事項は何ですか?

取り扱う際にはPPE(防護具)が必要です。特に手袋と面マスクは必須です。ドラフトチャンバーを使用して漏洩処理を行い、温度は常温、湿度は乾燥状態、容器はガラス容器...

84682-36-02-Amino-7,7-dimethox...
化合物よくある質問

8-硝基-咪唑并[1,2-a]吡啶とは何ですか?

8-硝基-咪唑并[1,2-a]吡啶は、CAS番号52310-46-0の化合物で、8-位に硝基を有する咪唑並みの结构をもつ吡啶の化合物です。この化合物は、酸化還元...

52310-46-08-Nitroimidazo[1,2-a...
化合物よくある質問

4-ブロモ-5-メトキシピリジン-2-甲醇の代替品はありますか?

4-ブロモ-5-メトキシピリジン-2-甲醇の代替品には、類似構造を持つ化合物や機能性に等しい代替試薬があります。例えば、4-クロロ-5-メトキシピリジン-2-甲...

1454849-84-3(4-Bromo-5-methoxy-2...
化合物よくある質問

全氟-1,2-二甲基環己烷を含む廃棄物はどのように処理すべきですか?

全氟-1,2-二甲基環己烷(CAS番号:306-98-9)の廃棄物は、特別な処理が必要です。まず、廃棄物を密閉容器に収集し、適切な防漏容器に保管します。次に、専...

306-98-91,1,2,2,3,3,4,4,5,6-...
化合物よくある質問

3-(溴甲基)苯乙酸の主な用途は何ですか?

3-(溴甲基)苯乙酸は主に研究用化学薬品として利用され、有機合成や医薬品の開発に用いられます。また、特定の化合物の合成中間体としても使用されることがあります。

118647-53-32-(3-(Bromomethyl)ph...
化合物よくある質問

5-イドキド-4-メチオキシ-6-メチルピリミジニン-2-アミンはどのように保存すればよいですか?

5-イドキド-4-メチオキシ-6-メチルピリミジニン-2-アミンは冷暗所で密栓の容器に保存し、直射日光を避けて保管することをお勧めします。温度は常温とし、湿気を...

23368-84-55-Iodo-4-methoxy-6-m...
化合物よくある質問

1-(2-溴-6-甲氧基苯基)乙酮を取り扱う際の実験室安全事項は何ですか?

実験室では、1-(2- Bromo-6-methoxyphenyl)ethanoneを取り扱う際には、ゴーグルや面具、手袋などのPPEを使用することが推奨されま...

380225-68-31-(2-Bromo-6-methoxy...
化合物よくある質問

5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ダイオキサボラロール-2-イル)-1,3-ジヒドロ-2-ベンゾフランは安全ですか?

5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ダイオキサボラロール-2-イル)-1,3-ジヒドロ-2-ベンゾフランは一般に安全ですが、取扱いには注意が必要です...

1352037-60-55-(4,4,5,5-Tetrameth...
化合物よくある質問

4-溴萘-1-甲酸の代替品はありますか?

4-溴萘-1-甲酸は比較的稀な化合物ですが、類似物としては、4-クロロ-1-ナフホリック酸やその他のブロモ置換ナフホリック酸が挙げられます。ただし、これらの代替...

16650-55-84-Bromo-1-naphthoic ...
化合物よくある質問

ε-白藜芦醇脱氢二聚体の代替品はありますか?

ε-白藜芦醇脱氢二聚体の代替品としては、ε-白藜芦醇、ポリフェノール類、フラボノイド類が挙げられます。これらは類似の化学構造と生物学的活性を持っています。ただし...

62218-08-05-{(2R,3R)-6-Hydroxy...
免責事項
このページに表示される学術雑誌情報は、参考および研究目的のみを目的としています。当社は雑誌出版社とは提携しておらず、投稿の取り扱いも行っておりません。出版に関するお問い合わせは、各雑誌出版社に直接ご連絡ください。
表示されている情報に誤りがある場合は、support@chemtradehub.com までご連絡ください。迅速に確認し、対応いたします。