UV-visible absorption spectrum of FAD and its reduced forms embedded in a cryptochrome protein

文献情報

出版日 2020-05-07
DOI 10.1039/D0CP01714K
インパクトファクター 3.676
著者

Karno Schwinn, Nicolas Ferré, Miquel Huix-Rotllant


原文を見る

要旨

Cryptochromes are a class of flavoproteins proposed as candidates to explain magnetoreception of animals, plants and bacteria. The main hypothesis is that a biradical is formed upon blue-light absorption by flavin adenine dinucleotide (FAD). In a protein milieu, the oxidized form of FAD can be reduced, leading to four redox derivative forms: anionic and neutral semi-reduced radicals, and anionic and neutral fully reduced forms. All these forms have a characteristic electronic absorption spectrum, with a strong vibrational resolution. Here, we carried out a normal mode analysis at the electrostatic embedding QM/MM level of theory to compute the vibrationally resolved absorption spectra of the five redox forms of FAD embedded in a plant cryptochrome. We show that explicitly accounting for vibrational broadening contributions to electronic transitions is essential to reproduce the experimental spectra. In the case of the neutral radical form of FAD, the absorption spectrum is reproduced only if the presence of a tryptophan radical is considered.

関連文献

An efficient and reusable carbon-supported platinum catalyst for aerobic oxidation of alcohols in water

Yun Hau Ng, Shigeru Ikeda, Takashi Harada, Yoshihiro Morita, Michio Matsumura

2008-05-07 Communication

DOI: 10.1039/B803912G

Back cover

Front/Back Matter

DOI: 10.1039/B614324P

Growth, detachment and transfer of highly-ordered TiO2nanotube arrays: use in dye-sensitized solar cells

Jong Hyeok Park, Tae-Woo Lee, Man Gu Kang

2008-05-07 Communication

DOI: 10.1039/B800660A

Azacalix[4]arene cation radicals: spin-delocalised doublet- and triplet-ground states observed in the macrocyclic m-phenylene system connected with nitrogen atoms

Koichi Ishibashi, Hirohito Tsue, Naoko Sakai, Satoshi Tokita, Kazuhiro Matsui, Jun Yamauchi, Rui Tamura

2008-04-11 Communication

DOI: 10.1039/B801127C

Microwave-assisted catalytic allylation of aldehydes promoted by a mesoporous silica-supported BINOL ligand in solid media

Guohua Liu, Yan Gao, Xiaoquan Lu, Mouming Liu, Fang Zhang, Hexing Li

2008-04-29 Communication

DOI: 10.1039/B803111H

Enantioselective rhodium-catalyzed addition of arylboronic acids to trifluoromethyl ketones

Sébastien L. X. Martina, Richard B. C. Jagt, Johannes G. de Vries, Ben L. Feringa, Adriaan J. Minnaard

2006-08-22 Communication

DOI: 10.1039/B609453H

Front cover

Cover

DOI: 10.1039/B809325N

Contents and Chemical Science

Front/Back Matter

DOI: 10.1039/B808460M

Nature of biological water: a femtosecond study

Kankan Bhattacharyya

2008-04-18 Feature Article

DOI: 10.1039/B800278A

Decelerated chirality interconversion of an optically inactive 310-helical peptide by metal chelation

Naoki Ousaka, Norihiko Tani, Ryo Sekiya

2008-04-21 Communication

DOI: 10.1039/B803080D

こちらもおすすめ

化合物よくある質問

除水剤ALT-201は安全ですか?

除水剤ALT-201は一般的に安全ですが、避けるべきは皮膚や目への接触です。適切な防護具を着用し、安全基準を守ることが重要です。

28770-01-62-(2-Isopropyl-1,3-o...
化合物よくある質問

「邻羟基阿托伐他汀内酯标准品」に適用される法規ガイドelinesは何ですか?

CAS番号163217-74-1の「邻羟基阿托伐他汀内酯标准品」は、GHS分類では危険物に分類されず、主にREACH規則とFDA/EPAの管理対象となります。R...

163217-74-1ortho-Hydroxy Atorva...
化合物よくある質問

メチル(3R)-3-アミノ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾファンラニン-5-カルボイル酸塩塩酸塩の主な用途は何ですか?

メチル(3R)-3-アミノ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾファンラニン-5-カルボイル酸塩塩酸塩は、医薬品や合成化学の研究に広く用いられます。また、特定の薬物の前...

2241594-15-8Methyl (3R)-3-amino-...
化合物よくある質問

トランス-4-メチルピロリジン-3-オール塩酸塩はどのように合成されますか?

トランス-4-メチルピロリジン-3-オール塩酸塩は、4-メチルピロリジンの塩酸塩化によって合成されます。一般的な合成方法では、4-メチルピロリジンを塩酸に加えて...

265108-42-7trans-4-Methylpyrrol...
化合物よくある質問

硫雜環丁烷-1,1-二氧化物は安全ですか?

硫雜環丁烷-1,1-二氧化物は安全ではありません。毒性は報告されていませんが、高温下で分解し、可燃性があるため、高圧ガスは注意が必要です。密閉した容器で保管し、...

5687-92-3Thietane 1,1-dioxide
化合物よくある質問

ブラエリリンの主な用途は何ですか?

ブラエリリンは主に医薬品製造における薬物アドベリンの合成材料として使用されます。また、研究用途や化学合成材料としても広く利用されています。

6054-10-02H, 8H-Benzo[1,2-b
化合物よくある質問

9-ヒドロキシエリプチシネ塩酸塩はどのように合成されますか?

9-ヒドロキシエリプチシネ塩酸塩は、エリプチシネから塩酸を添加することで合成されます。選択性は高いですが、収率は約70%です。

52238-35-49-Hydroxyellipticine...
化合物よくある質問

5-塩素-2-(メチルアミノ)フェニル-(2-塩素フェニル)メタン酮の物理化学的性質は何ですか?

5-塩素-2-(メチルアミノ)フェニル-(2-塩素フェニル)メタン酮のCAS番号は5621-86-3です。この化合物は白色の結晶性粉末で、分子量は415.03で...

5621-86-3[5-Chloro-2-(methyla...
化合物よくある質問

1-[2-(4-甲氧基-苯氧基)-乙基]-哌嗪はどのように保存すればよいですか?

1-[2-(4-甲氧基-苯氧基)-乙基]-哌嗪は、直射日光を避けて暗所に、室温(15-25℃)で保管し、密閉容器に入れることで安定性を保つことができます。

117132-44-21-[2-(4-Methoxy-phen...
化合物よくある質問

2-[3-(4-甲氧基フェニル)プロピル]-4,4,5,5-四メチル-1,3,2-ドイボロロールアンの主な用途は何ですか?

2-[3-(4-甲氧基フェニル)プロピル]-4,4,5,5-四メチル-1,3,2-ドイボロロールアンは、医薬品の合成、有機合成化学、および新材料の研究で使用され...

1073371-72-82-[3-(4-Methoxypheny...

掲載誌

Physical Chemistry Chemical Physics

Physical Chemistry Chemical Physics
CiteScore: 5.5
自己引用率: 10.3%
年間論文数: 3036

Physical Chemistry Chemical Physics (PCCP) is an international journal co-owned by 19 physical chemistry and physics societies from around the world. This journal publishes original, cutting-edge research in physical chemistry, chemical physics and biophysical chemistry. To be suitable for publication in PCCP, articles must include significant innovation and/or insight into physical chemistry; this is the most important criterion that reviewers and Editors will judge against when evaluating submissions. The journal has a broad scope and welcomes contributions spanning experiment, theory, computation and data science. Topical coverage includes spectroscopy, dynamics, kinetics, statistical mechanics, thermodynamics, electrochemistry, catalysis, surface science, quantum mechanics, quantum computing and machine learning. Interdisciplinary research areas such as polymers and soft matter, materials, nanoscience, energy, surfaces/interfaces, and biophysical chemistry are welcomed if they demonstrate significant innovation and/or insight into physical chemistry. Joined experimental/theoretical studies are particularly appreciated when complementary and based on up-to-date approaches.

おすすめ化合物

おすすめサプライヤー

免責事項
このページに表示される学術雑誌情報は、参考および研究目的のみを目的としています。当社は雑誌出版社とは提携しておらず、投稿の取り扱いも行っておりません。出版に関するお問い合わせは、各雑誌出版社に直接ご連絡ください。
表示されている情報に誤りがある場合は、support@chemtradehub.com までご連絡ください。迅速に確認し、対応いたします。