Vibrational spectroscopy and DFT calculations of the di-amino acid peptidel-aspartyl-l-glutamic acid in the zwitterionic state

文献情報

出版日 2009-06-11
DOI 10.1039/B903131F
インパクトファクター 3.676
著者

Nighat Kausar, Trevor J. Dines, Babur Z. Chowdhry, Bruce D. Alexander


原文を見る

要旨

Solid state IR and Raman as well as aqueous solution state Raman spectra are reported for the linear di-amino acid peptide L-aspartyl-L-glutamic acid (L-Asp-L-Glu); the solution state Raman spectrum has also been obtained for the N,O-deuterated derivative. SCF-DFT calculations at the B3-LYP/cc-pVDZ level established that the structure and vibrational spectra of L-Asp-L-Glu can be interpreted using a model of the peptide with ten hydrogen-bonded water molecules, in conjunction with the conductor-like polarizable continuum solvation method. The DFT calculations resulted in the computation of a stable zwitterionic structure, which displays trans-amide conformation. The vibrational spectra were computed at the optimised molecular geometry, enabling normal coordinate analysis, which yielded satisfactory agreement with the experimental IR and Raman data. Computed potential energy distributions of the normal modes provided detailed vibrational assignments.

関連文献

Surface chemistry of propanal, 2-propenol, and 1-propanol on Ru(001)

Dominic A. Esan, Michael Trenary

2017-03-06 Paper

DOI: 10.1039/C6CP08893G

Single-layer MoS2 formation by sulfidation of molybdenum oxides in different oxidation states on Au(111)

Norberto Salazar, Igor Beinik, Jeppe V. Lauritsen

2017-04-20 Paper

DOI: 10.1039/C7CP00958E

Chiral supramolecular organization from a sheet-like achiral gel: a study of chiral photoinduction

Jorge Royes, Víctor Polo, Santiago Uriel, Luis Oriol, Milagros Piñol, Rosa M. Tejedor

2017-05-05 Paper

DOI: 10.1039/C7CP01739A

Loss channels in triplet–triplet annihilation photon upconversion: importance of annihilator singlet and triplet surface shapes

Victor Gray, Ambra Dreos, Paul Erhart, Bo Albinsson, Kasper Moth-Poulsen, Maria Abrahamsson

2017-04-05 Paper

DOI: 10.1039/C7CP01368J

Electrode potential dependent desolvation and resolvation of germanium(100) in contact with aqueous perchlorate electrolytes

Fang Niu, Rainer Schulz, Arcesio Castañeda Medina, Rochus Schmid

2017-05-10 Paper

DOI: 10.1039/C6CP08908A

Ultrathin CoOx-modified hematite with low onset potential for solar water oxidation

Chun Du, Jun Wang, Xiao Liu, Jie Yang, Kun Cao, Yanwei Wen

2017-05-22 Paper

DOI: 10.1039/C7CP01588G

Local pH and effective pKA of weak polyelectrolytes – insights from computer simulations

Lucie Nová, Filip Uhlík, Peter Košovan

2017-02-28 Paper

DOI: 10.1039/C7CP00265C

A coarse-grained model for assisting the investigation of structure and dynamics of large nucleic acids by ion mobility spectrometry–mass spectrometry

S. Vangaveti, R. J. D'Esposito, J. L. Lippens, S. V. Ranganathan

2017-03-16 Paper

DOI: 10.1039/C7CP00717E

こちらもおすすめ

化合物よくある質問

2-メトキシ-4-(メチルスルフィニル)アミンの主な用途は何ですか?

2-メトキシ-4-(メチルスルフィニル)アミンは、主に医薬品および農薬の製造に使用されます。また、合成化学の一部として研究用材料としても利用されます。

41608-73-52-Methoxy-4-(methyls...
化合物よくある質問

4-溴甲基-3-甲氧基苯甲酸は安全ですか?

安全ではありません。触覚や吸入に注意が必要で、適切な防護具を使用してください。

118684-13-24-(Bromomethyl)-3-me...
化合物よくある質問

4,6-二氯-N-甲基ピラミジンアミンの代替品はありますか?

代替品としては、4,6-二クロロピラミジンアミンや他のピラミジン系化合物が考えられます。ただし、目的と用途によって最適な代替品は異なります。

10397-15-64,6-Dichloro-N-methy...
化合物よくある質問

6-氯-4-甲基-1H-吲哚を含む廃棄物はどのように処理すべきですか?

6-氯-4-甲基-1H-吲哚の廃棄物は、適切な容器に収集し、密閉して保管します。温度は常温、湿度は低く、直射日光を避けて保管することを推奨します。廃棄処理は専門...

885520-84-36-chloro-4-methyl-1H...
化合物よくある質問

2-フローユロ-4-(トリフルオロメチル)ベンゾイドについて「に適用される法規ガイドラインは何ですか」

2-フローユロ-4-(トリフルオロメチル)ベンゾイドのCAS番号は207974-08-1です。この化合物はGHS分類で毒性物質と有害な反応物質として分類されます...

207974-08-1[2-Fluoro-4-(trifluo...
化合物よくある質問

4-ニトロフェニルN-[(ベンゼルオキシルカーボンイル]グリシングリシングリシン酸はどのように保存すればよいですか?

4-ニトロフェニルN-[(ベンゼルオキシルカーボンイル]グリシングリシングリシン酸は、室温で暗所に保管し、乾燥した環境で保存することを推奨します。容器は密閉性の...

19811-64-44-Nitrophenyl N-[(be...
化合物よくある質問

イソデスロラタドリンの代替品はありますか?

イソデスロラタドリンの代替品としては、デスロラタドリンや他の抗ヒスタミン薬が挙げられます。具体的には、デスロラタドリン、ラセカミド、フェルタドリンなどが、症状や...

183198-49-4Iso Desloratadine
化合物よくある質問

5-甲氧基-1,2,3,4-四氢异喹啉盐酸盐はどのように合成されますか?

5-甲氧基-1,2,3,4-四氢异喹啉盐酸盐の一般的な合成方法は、メタノール中で5-メトキシ-1,2,3,4-四ヒュドロイソキシンを塩酸で塩化します。この反応で...

103030-69-95-Methoxy-1,2,3,4-te...
化合物よくある質問

4-アミノ-5-メトキシ-2-トルエンサルホニック酸についての法規ガイドラインは何ですか?

CAS番号6471-78-9の4-アミノ-5-メトキシ-2-トルエンサルホニック酸は、GHS分類では corrosive(腐食性)と識別されます。EUのREAC...

6471-78-94-Amino-5-Methoxy-2-...
化合物よくある質問

甲基孕酮を取り扱う際の実験室安全事項は何ですか?

甲基孕酮の取り扱いは、PPE(個人保護具)の使用が必要な重要な安全事項を伴います。防塵マスク、ゴーグル、手袋を着用することが推奨されます。ドラフトチャンバーを使...

204063-33-22-[(Diphenylmethyl)a...

掲載誌

Physical Chemistry Chemical Physics

Physical Chemistry Chemical Physics
CiteScore: 5.5
自己引用率: 10.3%
年間論文数: 3036

Physical Chemistry Chemical Physics (PCCP) is an international journal co-owned by 19 physical chemistry and physics societies from around the world. This journal publishes original, cutting-edge research in physical chemistry, chemical physics and biophysical chemistry. To be suitable for publication in PCCP, articles must include significant innovation and/or insight into physical chemistry; this is the most important criterion that reviewers and Editors will judge against when evaluating submissions. The journal has a broad scope and welcomes contributions spanning experiment, theory, computation and data science. Topical coverage includes spectroscopy, dynamics, kinetics, statistical mechanics, thermodynamics, electrochemistry, catalysis, surface science, quantum mechanics, quantum computing and machine learning. Interdisciplinary research areas such as polymers and soft matter, materials, nanoscience, energy, surfaces/interfaces, and biophysical chemistry are welcomed if they demonstrate significant innovation and/or insight into physical chemistry. Joined experimental/theoretical studies are particularly appreciated when complementary and based on up-to-date approaches.

おすすめ化合物

おすすめサプライヤー

免責事項
このページに表示される学術雑誌情報は、参考および研究目的のみを目的としています。当社は雑誌出版社とは提携しておらず、投稿の取り扱いも行っておりません。出版に関するお問い合わせは、各雑誌出版社に直接ご連絡ください。
表示されている情報に誤りがある場合は、support@chemtradehub.com までご連絡ください。迅速に確認し、対応いたします。